Меню

Rt lamp тест отличие от пцр



Какие бывают тесты на коронавирус: плюсы, минусы, принципы работы

Лаборатории предлагают разные тест-системы на коронавирус, которые значительно отличаются принципами работы. Какие у них различия, плюсы и минусы?

Метод ПЦР

Самый распространенный тест 0 это метод полимерной цепной реакции.

Как он работает? Если очень коротко, то все вирусы делятся на РНК-содержащие и ДНК-содержащие. Коронавирус относится к РНК-содержащим вирусам, его последовательность уже расшифрована. Если человек здоров, то первая цепочка ДНК не выстроится — химическим веществам, подобранным для строительства, не за что будет «зацепиться». Если болен, то к РНК-цепочке присоединяются в результате химической реакции другие, и в итоге получается молекула ДНК, которая служит матрицей.

Эту матрицу многократно размножают, помещают в раствор со специальным набором химических веществ в устройство-амплификатор, в котором периодически меняется температура от 50 до 92 градусов. В нем, как в ксероксе, ДНК копируется.

После этого отправляют всё это на электрофорез, где можно увидеть размноженные копии ДНК. Если ДНК заряжена отрицательно, и в электрическом поле ее притягивает положительный заряд. Притягиваясь к нему, размноженная ДНК проходит через краситель. Чем больше фрагмент ДНК, тем медленнее он двигается и тем ярче окрашивается. Если же человек здоров, то форез ничего не покажет.

Мазок из ротоглотки.

Современные методы позволяют точно подобрать набор веществ, нужных для реакции, а значит, «достроить» именно ДНК SARS-Cov-2, а не другого похожего.

Высокая цена. Праймеры и амплификаторы стоят недешево. Второй минус 0 время. Ждать, пока размножится ДНК, нужно несколько часов, а с учетом транспортировки до лаборатории результаты теста пациент может узнать через сутки и более.

Эффективность теста 0 примерно 80%. Праймеры для реакции подбираются на основе информации об РНК вируса. Но фрагмент с теми же «буквами» может оказаться и в других микроорганизмах пробы 0 отсюда ложноположительный результат. Ложноотрицательный результат получится, если вирусные частицы ушли из ротоглотки, спустились дальше по дыхательному пути. Тогда в пробе просто не окажется РНК вируса.

Если человек контактировал с пациентом с подтвержденным коронавирусом.

Метод петлевой изотермической амплификации, LAMP

Метод петлевой изотермической амплификации, LAMP, считается упрощенной версией ПЦР. Производители тест-систем обещают точность метода до 94%. Он похож на предыдущий метод, но более простой. РНК вируса также достраивается до ДНК, а дальше копирование идет при постоянной температуре и занимает всего 20-30 минут. Результат оценивает лаборант — мутный осадок говорит о вирусе. Некоторые производители добавляют в тест-системы флуоросцентные красители, чтобы наличие вируса не вызывало сомнений.

Достоинства и недостатки метода

Метод лучше выявляет нужный вирус. Его не собьет присутствие ДНК с похожим фрагментом другого микроорганизма. Анализ занимает не больше 40 минут. Но лабораторий таких мало — всего две компании предлагают такой тест. Тест может лишь подтвердить или опровергнуть присутствие вируса в организме. Давать прогноз, как будет протекать болезнь, понадобится ли конкретному пациенту экстренная помощь, на его основе нельзя.

Если человек контактировал с пациентом с подтвержденным коронавирусом, а также людям, входящим в группу риска.

Тест на антитела

В качестве материала для исследования берется кровь. В ней стандартным способом определяют иммуноглобулины: IgG и IgM. Иммуноглобулины M первыми вырабатываются в ответ на вирусную атаку, их наличие в крови говорит об острой фазе заболевания.

Иммуноглобулины G появляются в крови в среднем спустя 5 дней после иммуноглобулинов М. Если они обнаруживаются в крови, то это может говорить о том, что заболевание прошло острую фазу либо уже перенесено, организм справился с инфекцией и даже выработал иммунитет.

В России тест-система уже зарегистрирована, но пока она недоступна для широкого применения.

Достоинства и недостатки метода

Тест на антитела позволяет узнать стадию заболевания, а также предположить тяжесть его течения. В ряде случаев он помогает выявить людей, перенесших коронавирус бессимптомно и выработавших иммунитет. Тест дает результаты за 10-15 минут.

Но возможен и ложноотрицательный результат, так как известны еще не все антитела к коронавирусу. Кроме того, антитела появляются в крови не сразу, и тест, проведенный на следующий день после инфицирования, может не дать результатов.

У вас первые симптомы заболевания; вы контактировали с пациентом; есть подозрение, что вы носитель вируса (хотите быть уверенными в том, что у вас иммунитет).

Источник

Какие существуют тесты на COVID-19 и чем они отличаются

Какие существуют тесты на COVID-19 и чем они отличаются
HayDmitriy / Depositphotos.com

Роспотребнадзор выпустил понятную памятку для граждан без медицинского или биологического образования о том, какие исследования на КОВИД-19 сейчас широко доступны (информация Роспотребнадзора от 8 июня 2020 г.).

Читайте также:  Компьютерно томографическая диагностика липоидных пневмоний тест с ответами

Напомним, что наиболее распространены 4 вида тестов:

  • метод ПЦР (он же – молекулярная диагностика, он же – метод амплификации нуклеиновых кислот, он же – ОТ ПЦР, он же – RT-LAMP). Метод позволяет найти РНК коронавируса. Если РНК найдена – человек инфицирован. Если РНК не найдена — человек либо не инфицирован, либо инфицирован, но вирусная нагрузка очень маленькая, либо инфицирован, но уже серьезно – вирус «спустился» в лёгкие, либо был инфицирован, но уже выздоровел. Для исследования по этому методу берется мазок из носа или ротоглотки;
  • иммунохроматографический экспресс-анализ на антитела к COVID. Позволяет быстро выяснить, болел ли пациент (или, может, болеет прямо сейчас). Антитела IgM и IgG – это иммунные клетки, которые вырабатываются в организме человека в результате его контакта с вирусом в самом начале заболевания. Для экспресс-теста нужна кровь – из пальца или из вены;
  • анализ на эти же антитела, но методом иммуноферментного анализа крови (ИФА), он же – иммунохемилюминесцентный анализ (ИХЛА). Не только покажет, что есть антитела IgM и IgG, но и сколько их (их титр). Другими словами, находится ли пациент в стадии болезни, или у него уже сформирован иммунитет (правда, еще неясно, силен ли этот иммунитет, как долго он действует и какой, собственно, титр является «хорошим»). Для анализа возьмут кровь из вены;
  • иммунохроматографический экспресс-анализ на вирусные антигены (белки в РНК коронавируса, на которые реагирует иммунная система). Показывает, заражен ли человек в момент взятия мазка (его берут из носа). Достоинства: очень быстрый, можно «отстреляться» прямо на приеме у врача. Минусы: неточный.

Все важные документы и новости о коронавирусе COVID-19 – в ежедневной рассылке Подписаться

Таким образом, понятно, на какой тест нужно «соглашаться». Например, если гражданин подозревает, что уже переболел COVID-19, он заинтересуется анализом на антитела методом ИФА/ИХЛА. А если у него ОРВИ, но он уверен, что с КОВИДом пока не сталкивался, то можно провериться на РНК или антигены.

Источник

Какие есть тесты на коронавирус и зачем они нужны?

Сегодня в РФ используются разные тест-системы для выявления инфицирования человека коронавирусом: ПЦР, ОТ-ПЦР, RT-LAMP, ИФА на антитела. Рассмотрим особенности каждого.

Что делает тест точным

Степень точности тестов на Ковид вариабельна, если верить статистическим данным. В случае, когда чувствительность теста к коронавирусу не превышает 30%, он не регистрируется на территории нашей страны. В среднем точность результатов составляет около 80%, но есть тест-системы, которые демонстрируют достоверность в пределах 95%.

Зависит точность теста от соблюдения правил подготовки к нему, забора и транспортировки биоматериала в лабораторию и оптимального выбора методики исследования для ответа на поставленный врачами вопрос.

Виды тестов на коронавирус

Быстрая и достоверная диагностика Covid-19 – первый шаг на пути к адекватному лечению, профилактике. Чтобы определить наличие вируса в организме, применяется экспресс-тестирование на антитела, методика ПЦР и LAMP.

Бессимптомным носителям коронавируса и лицам, контактировавшим с заболевшими рекомендован ПЦР-тест. Если же цель анализа – узнать, переболели ли вы коронавирусом, то для вас – антитела. Если вы входите в группу риска заражения Ковидом – разумнее всего провести экспресс-тест на антитела или исследование LAMP.

ПЦР-тест или метод полимеразной цепной реакции наиболее точен из всех представленных вариантов, поскольку подтверждает наличие именно коронавируса в исследуемом биоматериале. Это позволяет определить, болен ли человек в данный момент времени даже при бессимптомном варианте течения Ковида. Наиболее точный ответ может быть получен, если забор материала на тестирование проведен на 7-10 день с момента первых симптомов патологии.

Мазок на ПЦР берут со слизистой носоглотки, иногда достаточно слюны из ротовой полости. Результаты готовы через сутки-двое. Есть и экспресс-вариант теста с готовностью в течение получаса. Достоверность данных – более 80%.

Читайте также: как проводят ПЦР тест на коронавирус

ОТ-ПЦР

Методика обратной транскрипции или ОТ-ПЦР – основа классики полимеразной реакции. Суть в том, что специфический фрагмента РНК из взятого биоматериала, то есть, одну цепочку рибонуклеиновых кислот дополняют второй до ДНК методом обратной транскрипции, и уже ее определяют традиционной ПЦР после многочисленных репликаций.

При этом РНК может искусственно комбинироваться со второй моноцепочкой, чтобы превратиться в ДНК только, если она первоначально содержит частички коронавируса. Иначе вторая репликационная цепочка заведомо зараженного коронавирусом материала не прикрепится к ней. Не будет общих рецепторов. Обратная транскрипция в клетке – важнейший этап жизненного цикла коронавирусов.

RT-LAMP

Петлевая изотермическая амплификация (LAMP) – относительно новая методика. Ее особенность и отличие от классической ПЦР в том, что репликация происходит при температуре 65°С с использованием не более 6 праймеров (фрагментов НК). Все происходящие изменения видны на глаз в пробирке, не требуют дорогостоящего оборудования. Тест, по словам разработчиков, позволяет определить наличие Ковида у человека на самых ранних стадиях с абсолютной (100%) точностью. Такая технология пригодна для работы в любых публичных местах.

Читайте также:  Укажите какой тип тугоухости развивается при евстахиите тест

На подходе тест ПЦР, который будет сразу видеть и РНК и ДНК коронавируса, не требуя репликации, обратной транскрипции.

Тесты на антитела

Серологический анализ коронавируса – это обнаружение в крови человека антител к Ковиду. Поскольку все коронавирусы разные специфичность такого тестирования именно на антитела к SARS-CoV-2 чрезвычайно важна. На сегодня известны уже три модификации коронавируса, все они тестируются серологически. Бесспорным преимуществом теста на антитела является возможность понять, переболел ли человек в принципе Ковидом без симптомов, и имеет ли он иммунитет к коронавирусу. При этом совсем не обязательно, чтобы вирус присутствовал в носоглотке или ротоглотке. На исследование берут кровь из пальца или вены: в кровотоке антитела циркулирует с 5 дня инфицирования и сохраняются почти полтора месяца у уже пролеченных пациентов.

Суть теста — выявление антител на антиген-коронавирус серологически, то есть реакцией антиген-антитело. Проводится тест способом ИФА ИФЛА (ИХЛА) и их шведской версией ELISA. Серологический тест устанавливает, есть ли у человека антитела к SARS-CoV-2 или отсутствуют. Поскольку у всех антитела на коронавирус вырабатываются на разных сроках инфицирования, для надежности тест повторяют дважды, с интервалом в две недели.

В случае, если тест на иммуноглобулины (антитела) дал положительный результат, а человек уже переболел Ковидом, то для подтверждения отсутствия коронавируса в организме (то есть полного выздоровления) делают еще и ПЦР-тест. Если он – отрицательный можно говорить о полном выздоровлении и наличии иммунитета.

Почему тест на антитела эффективнее других

Наверное, некорректно говорить о преимущественной эффективности серологического тестирования. Задачи у ПЦР и антител разные. Тест на антитела показывает, сталкивался ли человек с новым коронавирусом при бессимптомном течении, а также отвечает на вопрос о наличии и стойкости иммунитета после Ковида. А вот понять, точно болен ли пациент в настоящее время, можно только с помощью ПЦР-диагностики.

Источник

RT-LAMP тесты на коронавирус Covid-19

Диагностировать SARS-CoV-2 (вирусный патоген COVID-19) можно не только с помощью классического тестирования PCR. Ученые разработали новую тест-систему, которая помогает определить коронавирусную инфекцию всего за 30 минут, анализируя биоматериал пациента. Новый метод практичен и не требует дорогостоящего оборудования.

Суть теста RT-LAMP на коронавирус

Изотермическая амплификация с помощью обратной транскрипционной петли (RT-LAMP) – относительно новый метод в молекулярной биологии. Он помогает обнаружить РНК или генетический материал COVID-19 в тестируемом биологическом образце. Это исследование является упрощенной и удешевленной альтернативой стандартного теста ПЦР (полимеразная цепная реакция).

Методика изотермической амплификации, основанная на петле, была изобретена в 2000 году. Она является мощным инструментом для увеличения копий гена в простых условиях, требующих только водяной бани при 58-65°C и 30-60-минутной инкубации.

Скорость получения результата с помощью метода LAMP намного выше, чем у классического теста PCR. Это связано с тем, что все реакции проводятся в одной пробирке. В специальную реакционную смесь добавляют колориметрический индикатор. Если биоматериал инфицирован, специалист невооруженным глазом увидит изменение цвета.

Таким образом, к основным преимуществам петлевой изо­термической амплификации относятся:

  1. Простота. RT-LAMP выполняется в один этап, детекция продуктов реакции может быть проведена невооруженным глазом.
  2. Чувствительность и специфичность. Применение 4 или 6 праймеров в отличие от полимеразной цепной реакции.
  3. Скорость. Конечные результаты анализа можно получить через 15-60 минут, а не через 2 дня.
  4. Экономичность. Метод не требует сложного оборудования и дорогих материалов.

Тест RT-LAMP на ковид применяют для более быстрого исследования большого количества людей.

Когда требуется тест на коронавирус

Основные клинические симптомы коронавируса похожи на грипп и другие простудные заболевания.

В России лабораторному исследованию в первую очередь подлежат определенные категории граждан:

  • все пожилые люди старше 65 лет, обратившиеся за помощью к врачу с признаками простудных болезней, гриппа;
  • лица, которые близко контактировали с больным COVID-19;
  • все пациенты с диагнозом «внебольничная пневмония»;
  • медицинские работники с признаками ОРВИ и высоким риском инфицирования коронавирусом на рабочих местах.

Тестирование проходят люди, которые находятся в учреждениях постоянного пребывания (дома-интернаты, кадетские корпуса и т.д.), имеют клинические проявления простудных заболеваний, гриппа. Сотрудники, которые работают в таких организациях, также должны сдавать анализ.

Читайте также:  Если предварительное следствие приостановлено следователь вправе тест

По требованиям Роспотребнадзора, если у человека выявлен коронавирус, для выписки и подтверждения выздоровления необходимо два отрицательных ПЦР-теста.

У многих людей болезнь может протекать бессимптомно, в легкой форме. Инкубационный период длится 2-14 суток (чаще 5-7), после чего у пациента появляются симптомы, характерные для ОРВИ.

Особенно опасно тяжелое течение ковида, при котором часто развивается острый респираторный синдром (Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS) на фоне двусторонней пневмонии.

Где пройти тест RT-LAMP на ковид

До недавнего времени в России пройти тест RT-LAMP на Covid-19 можно было бесплатно только по специальным направлениям от врачей в государственных учреждениях. Они выдавались людям, которые имели симптомы ОРВИ, контактировали с зараженными или вернулись из стран с неблагоприятной коронавирусной обстановкой.

На данный момент платный тест на коронавирус можно сделать во многих частных медицинских лабораториях. В коммерческие центры обращаются люди, у которых нет симптомов болезни. Они не могут пройти бесплатный тест на коронавирус в поликлинике, т.к. в государственных учреждениях анализ назначают только при наличии признаков гриппа, респираторных заболеваний.

Узнать цену теста RT-LAMP на коронавирус можно по телефону у оператора или на сайте клиники. Расчет за все услуги ведется только в рублях.

Подготовка к исследованию в клинике

Обязательные условия для анализа – отсутствие контактов с заболевшими COVID-19 в течение 14 дней и симптомов ОРВИ. Тестирование представляет собой мазок из горла или носа. Забор материала проводится при температуре тела не выше 36,9°.

За 3-4 часа до теста:

  • запрещается рассасывать антисептические пастилки, орошать полость рта и носа спреями, закапывать назальные капли;
  • необходимо воздержаться от приема пищи.

За час нужно отказаться от курения. Если полость носа заполнена слизью, перед тестированием рекомендуется ее высморкать.

При посещении клиники пациенты должны иметь с собой паспорт, приходить в маске, одноразовых перчатках. Забор биоматериала на определение вируса проводится с соблюдением всех санитарных эпидемиологических норм.

Оставайтесь дома и вызовите бригаду медиков, если у вас повышена температура, кашель, насморк, слабость, головная и мышечная боль.

Тестирование на дому

Пройти тестирование на коронавирусную инфекцию на дому можно людям:

  • без наличия симптомов простудных заболеваний и гриппа, в т.ч. входящих в группу риска;
  • без признаков ОРВИ, но имеющих контакты с лицами, приехавшими из других государств, где зарегистрированы случаи новой коронавирусной инфекции;
  • с симптомами простудных болезней, если это первичное обращение и до этого не проводилось обследование на COVID-19.

К пациенту выезжает медицинская сестра. Перед забором материала он подписывает документ, в котором соглашается на проведение процедуры. Набор для петлевой изотермической амплификации ДНК и РНК специалист привозит с собой. В него входят:

  • вода, свободная от нуклеаз;
  • смесь праймеров;
  • матрица ДНК или РНК;
  • термостат медицинский – водяная баня, реал-тайм турбидиметр или термоциклер;
  • пластиковые расходные материалы.

Набор предназначен для быстрой подготовки реакционной смеси при комнатной температуре.

В частной клинике не берут анализ у людей без симптомов, которые имеют тесный контакт с инфицированными людьми (например, в семье, коллективе на работе). В этом случае согласно рекомендациям Министерства здравоохранения РФ пациенты направляются в больницы.

Результаты тестирования

Ни один из используемых сегодня методов тестирования на COVID‑19 не может дать 100%-но точного результата. Дальнейшие действия медицинского персонала зависят от того, какое заключение выдала лаборатория.

В случае положительного результата тестирования на новую коронавирусную инфекцию:

  1. Устанавливаются плановые даты повторного забора материала на исследование (3-й и 11-й дни после первого теста).
  2. Производится опрос пациента о его состоянии. Принимается решение о лечении на дому или в стационаре.
  3. Определяется первый круг контактов с больным. При наличии у них симптомов простуды или гриппа проводится забор материала для тестирования.

Если ваш результат анализа будет сомнительным или положительным, по требованию Роспотребнадзора он будет передан в поликлинику по месту жительства.

Также у нас проводится исследование на антитела IgA и IgG к коронавирусу SARS-CoV-2 (COVID-19).

Результаты тестирования могут быть искажены на фоне приема антивирусных препаратов. Отрицательным может быть тест и у лица, только что заразившегося, когда вирус еще не проник дальше слизистых.

В России проведение платного теста RT-LAMP на выявление COVID-19 возможно по предварительной записи, строго по паспорту. Делают его только в лабораториях, которым официально разрешено выполнять такой вид диагностики. Получить подробную информацию о том, сколько точно будет стоить анализ, можно у оператора по телефону. Также цена (в руб) теста RT-LAMP на коронавирус указана в прайсе на сайте.

Источник